Щек/ов/ин/а, -ы с. ж. От основы щеков/ой. СО — суффиксальный, суфф. -ин- со значением ‘мясо, вырезанное со щек животного’; щековина = щековое (мясо).
«Щекови́на, ы, ж. Разг. Мясо от щек животного» (БАС 17, 1655).
«В общем среднем на 1 человека в день приходится 97,92 г мясных продуктов (свежей говядины 73,35 г, гусаков и щековины 0,89 г, баранины 0,01 г, свинины 8,23 г, ветчины и колбасы по 0,01 г и солонины 15,42 г)» [Ф.Ф. Эрисман. Пищевая гигиена (1871-1908)].